日軍政府佔領香港後,委派日本工程師為總督府(現稱香港禮賓府)進行改建,工程範圍包括將屋頂改為日式瓦頂,以及加建一座中央塔樓,兩項改動仍保留至今。 遮打爵士去世後,他的私人珍藏(稱為「遮打藏品」)包括油畫、水彩、素描、版畫及攝影等,按其遺願捐贈予香港政府。1941年,香港淪陷前夕,這些重要藏品秘密藏於總督府地下保險庫、酒窖及花園地底。1942年,日軍政府改建總督府時,工程判頭冼子霖發現遭棄置的畫作,冒險把其中23幅偷運出來,藏於家鄉,並於戰後悉數交還香港政府。